1、看原料選擇

有機肥的原料品類較多，質量也良莠不齊，效果差別也很大。常用的有畜禽糞便、以及餅粕等，木質素類原料的有機肥雖然有機質含量較高，但由于木質素在土壤中分解很困難，用其做肥料效果可想而知。

2、選擇腐熟有機肥

新鮮的農家肥施入土壤后，所含的有機態養分不能立即被作物吸收利用，并且未經腐熟的農家肥施入土壤后，由于未腐熟的有機肥含有病菌，蟲卵和雜草種子，且在腐熟過程中產生高溫和有機酸，嚴重危害作物的正常生長,所以有機肥必須經過完全腐熟后才能施用。

3、選擇合適的有機肥

在種植瓜類、番茄等生長期長的蔬菜作物時，不要單純使用商品有機肥，也不能單純憑價格來衡量或者選擇某種有機肥。按照作物需要后期追施化肥，可以避免商品有機肥持效期短的缺點。